GJB9001B-2009于2010年4月1日实施。参照国家标准换版的做法,GJB9001A-2001证书向GJB9001B-2009转换的时间为两年(2010.4月1日至2012年3月31日)，相对于GB/T19001-2008《质量管理体系要求》的变化而言，GJB9001B-2009标准的变化还是比较大的，主要差异内容如下：

①  GJB9001B-2009标准 3术语和定义中明确，“本标准军用产品特殊要求采用GJB1405中的术语和定义。”目前见到的最新版本是 GJB1405A-2006《装备质量管理术语》。

②  GJB9001B-2009中有两处增加了对程序文件的要求，分别是在6.5质量信息，“组织应编制形成文件的程序，确定质量信息的需求，按规定收集、贮存、传递、处理和利用。产品质量信息管理应满足顾客的需要。”和7.3.8新产品试制，“组织应编制形成文件的新产品试制过程控制程序，以保证：……。”

③  GJB9001B-2009中明确要求形成文件的有7.1产品实现的策划，“组织应编制质量计划(质量保证大纲)。顾客要求时，质量计划及调整应征得顾客同意。”和7.7技术状态管理，“组织应实施技术状态管理，……。顾客要求时，技术状态管理计划、技术状态基线确定及其更改应经顾客同意。”关于采购产品的验证7.4.3“组织应编制采购产品的验证准则。顾客参加验证活动不能免除组织提供可接受产品责任。组织应保持采购产品的验证记录（见4.2.4）。当组织委托供方进行验证时，应规定委托的要求并保持委托和验证的记录（见4.2.4）。”对于如何编制质量计划(质量保证大纲)，可参阅GB/T19015-2008《质量管理体系 质量计划指南》和GJB1406A-2005《产品质量保证大纲要求》。关于如何作好技术状态管理，可参阅GB/T19017-2008《质量管理体系 技术状态管理指南》、GJB3206-1998《技术状态管理》及GJB5709-2006《装备技术状态管理监督要求》等，重点作好设计和开发的更改控制。

④  对于外包过程是这样说的：“组织应对外包过程进行评审，批准后予以实施，并监督外包过程的执行。顾客要求时，外包过程须经顾客同意（外协是外包的一种形式）。”

⑤  在军工五项技术方面增加了环境适应性，即“适用时，组织应建立、实施和保持产品的可靠性、维修性、保障性、测试性、安全性和环境适应性档等工作过程。参见GJB450、GJB368、GJB3872、GJB2547、GJB900、GJB4239、GJB1909等。”

⑥  对于风险管理宜作“故障模式影响和危害性分析（FMECA），制定风险管理计划，在产品实现各阶段进行风险分析和评估，形成各阶段风险分析文件，必要时提供给顾客。”。

⑦  涉及软件管理的“适用时，组织可参照GJB 5000的要求，建立、实施并改进其软件过程。”目前见到的最新版本是GJB5000A-2008《军用软件研制能力成熟度模型》。